Det var Shelbys motorsportsbaggrund, der fik Goodyear til at finansiere skabelsen af den første Cobra-baserede Daytona Coupe, som var designet af Peter Brock. Denne elegante racerbil med dens banebrydende aerodynamik endte med at slå Ferrari 250 GTO'erne og vinde i GT-klassen, hvilket gav en samlet fjerdeplads ved Le Mans i 1964. Men der var endnu mere i vente.
Da Shelby omsider kunne tage rattet i Fords GT40-program, kom der hurtigt fart bag den ikoniske bil. Det blev dog ikke en særligt lovende start. I 1964 var der slet ingen af de meget omtalte nye Ford-biler, der gennemførte Le Mans – eller noget andet løb.
Men som Shelby stolt bemærkede, lykkedes det dem dog at give Enzo Ferrari sved på panden, da de nåede helt op på 350 km/t på den berømte Mulsanne-langside.
I 1965 gentog historien sig, og Ferrari gjorde igen rent bord på Le Mans-podiet, uden at en eneste GT40 krydsede mållinjen. 1965 var også året, hvor North American Racing Teams (NART) Ferrari 250 LM, kørt af Masten Gregory og Jochen Rindt, helt uventet kunne sikre Goodyear den første samlede sejr i 24-timersløbet.