Shelbyjev dirkaški pedigre je pripomogel k temu, da je Goodyear financiral prvi dirkalnik z zasnovo Cobra, model Daytona Coupe, ki ga je oblikoval Peter Brock. Ta elegantni dirkalnik z inovativno aerodinamično obliko je leta 1964 premagal Ferrarije 250 GTO v razredu GT in v Le Mansu dosegel skupno četrto mesto. Toda pozneje so dosegli še več.
S Shelbyjem končno za krmilom Fordovega programa GT40 je kultni avtomobil hitro napredoval. Toda začetki niso obetali veliko. V sezoni 1964 ni noben od opevanih Fordovih dirkalnikov končal dirke v Le Mansu, niti nobene druge dirke.As Shelby proudly noted however, they did succeed in striking fear into Enzo Ferrari, notching up 218mph on the famous Mulsanne Straight.
Shelby je ponosno naznanil, da so uspeli prestrašiti Enza Ferrarija, ko so na sloviti ravnini dirkališča v Mulsannu dosegli hitrost 350 km/h.
V sezoni 1965 je bila zgodba podobna, saj je Ferrari znova stal na vseh treh stopničkah v Le Mansu, niti en dirkalnik GT40 pa ni prečkal ciljne črte. V letu 1965 sta Masten Gregory in Jochen Rindt z modelom Ferrari 250 LM ameriškega moštva North American Racing Team (NART) nepričakovano zagotovila prvo skupno zmago za Goodyear na 24 urah Le Mansa.